À travers des objets utilitaires (mortiers et pilons, mâche-bouchons, alambics), des pots de pharmacie (faïences de Nevers, silènes en bois), des estampes, des affiches et des ouvrages, les collections de la pharmacie offrent un panorama de l’histoire et de l’art pharmaceutiques. Le droguier Menier, conçu par Jean Antoine Brutus Menier, fondateur de la chocolaterie du même nom, en est la pièce majeure : constitué de près de 800 pots en verre soufflé, il réunit les drogues essentielles de l’arsenal thérapeutique au XIXème siècle.